Учебный отдел Барнаульского ВВАУЛ, пожалуй, был самым главным в системе подготовки будущих военных лётчиков-инженеров. Если в учебных авиационных полках готовили именно лётчиков, то как раз учебный отдел в большей степени выполнял задачу по подготовке именно лётчиков-инженеров. Хотя в целом эти две структуры выполняли единую задачу, ведь готовили лётчиков-инженеров по эксплуатации самолётов в воздухе. Поэтому на должность начальника учебного отдела и его заместителей подбирали людей очень внимательно, брали только опытных и грамотных офицеров мастеров профессионалов.
Начальники учебного отдела
1 Полковник Пашковский Анатолий Анисимович с 13.05.1969 по 20.02.1974
2 Полковник Кропанев Борис Петрович с 15.08.1974 по 21.08.1985
3 Полковник Барбашов Пётр Васильевич с 12.07.1986 по 16.11.1987
4 Полковник Карпов Вадим Михайлович с 26.12.1987 по 07.03.1995
5 Полковник Милушкин Виктор Евгеньевич с 18.02.1995 по 27.04.1996
6 Полковник Атясов Владимир Георгиевич с 07.08.1996 по 1999 (он участвовал в закрытии училища)
Заместители начальника учебно-лётного (учебного) отдела
1 Инженер-подполковник Ильин Василий Сергеевич 18.05.1968 06.05.1975
2 Полковник Курйоз Николай Андреевич 11.08.1976 04.04.1985
3 Подполковник Трембовецкий Вадим Николаевич 09.06.1982 16.11.1987 по научной работе
4 Полковник Симонов Владимир Иванович 11.06.1985 13.09.1988
5 Подполковник Милушкин Виктор Евгеньевич 28.06.1988 18.02.1995
6 Полковник Деев Александр Васильевич 14.06.1989 08.12.1991 по научной работе
7 Полковник Пасека Михаил Прокофьевич 08.12.1991 01.11.1993 по научной работе
8 Подполковник Яшкин Василий Васильевич 31.01.1994 20.07.1994 по научной работе
9 Подполковник Топчиёв Геннадий Степанович 31.07.1995 15.07.1996
10 Полковник Юферев Валерий Григорьевич 27.11.1996 04.02.1999 по научной работе
11 Полковник Мозжилин Евгений Евгеньевич 05.10.1998 - 1999
